La Justice League, dirigée par l'Archer Vert, explore l'arctique à la recherche de Clark, qui a disparu après que la Forteresse se soit effondrée. L'équipe est immédiatement confrontée à Tess Mercer, la nouvelle directrice de la Luthorcorp. Pendant ce temps, Chloe est retenue prisonnière par un groupe qui a découvert qu'elle a un nouveau don tandis que Clark est dépossédé de ses pouvoirs par Jor-El.

   C'est le premier jour de Clark au Daily Planet avec Loïs et le duo enquête immédiatement sur l'explosion d'un bus à l'extérieur du bâtiment. Clark sauve Bette, une jeune fille qui tisse rapidement des liens d'amitié avec Chloe grâce à leurs dons respectifs, mais Bette cache un grand secret. L'ambulancier Davis Bloom arrive à Metropolis et est directement envoyé vers Chloe.

   Lors d'une soirée de charité, Oliver s'effondre et révèle qu'il ne lui reste plus que 24 heures à vivre. Clark et Chloe applellent Davis à l'aide mais son pronostic n'est pas encourageant. Délirant, Oliver se souvient de l'époque où il vivait sur une île et où il a appris à se servir d'un arc et d'une flèche. Il se remémore également la première fois où il a recontré Tess sur cette île, après qu'elle eut été kidnappée par un drogué. Chloe, très inquiète, décide d'utiliser ses nouveaux pouvoirs pour sauver Oliver, ce qui choque Clark.

   En réalisant des tests sur le cristal de Clark, Tess et son équipe provoquent une réaction inattendue. En effet, un faisceau de lumière se répand dans l'univers, déclenchant ainsi l'arrivée de Maxima, une reine de la planète Almerac à la recherche de son âme soeur, qui selon elle est celui qui a envoyé le signal. Malheureusement, la puissance de Maxima est trop grande pour les hommes et elle les tue dès qu'elle les embrasse. Quand la séduisante jeune femme débarque à Metropolis, elle jette son dévolu sur Jimmy.

   Après avoir quitté leur fête de fiançailles, Chloe et Jimmy sont enlevés par un bijoutier psychotique. Très marqué émotionnellement par l'infidélité de sa femme, il capture maintenant des couples et les soumet à un détecteur de mensonges avec l'aide d'une kryptonite améliorée qui les choque s'ils mentent. Le ravisseur demande à Chloe si elle aime quelqu'un d'autre. Pendant ce temps, dans le but de retrouver leurs amis, Clark et Loïs se font passer pour un couple et sont eux-mêmes kidnapper puis interrogés dans le but de savoir ce qu'ils ressentent l'un pour l'autre.

   Clark se penche sur une récente attaque dans un théâtre, qui est peut-être l'oeuvre d'un tueur en série. Pensant qu'il pourrait s'agir de quelqu'un infecté par les météorites, il exige que Chloe lui fournisse le noms des personnes qui la consultent à la Fondation Isis, ce qui provoque un clash entre les deux amis. Davis craint que ses malaises ne signifient qu'il soit le tueur et il recueille les éléments de preuves qui pourraient l'impliquer. Craignant le pire, il confesse ses soupçons à Chloe.

   Jimmy prend une photo de Clark arrivant en super vitesse pour sauver Loïs d'un agresseur et parvient à identifier du rouge et du bleu qui sont flous sur la pellicule. Le jeune photographe montre l'image à Tess, qui décide de la mettre en première page du Daily Planet. Clark, qui craint que son identité ne soit découverte, demande à Chloe de mettre Jimmy sur une fausse piste mais elle refuse.

   Clark reçoit un paquet anonyme contenant le cristal que Tess a trouvé dans l'Arctique. Quand il prend le cristal, il l'active et atterrit dans la Zone Fantôme avec Loïs. Les deux amis retrouvent Kara et cette dernière ouvre un portail pour que Loïs reparte. Mais Faora, la femme de Zod, s'échappe avec elle et prend possession de son corps. C'est donc une Loïs possédée qui se déchaîne sur Metropolis.

   Brainiac commence à supprimer les souvenirs de Chloe un par un jusqu'à ce qu'elle ne se souvienne que de Davis. Clark réalise alors que le seul moyen pour empêcher Brainiac de prendre le contrôle de l'esprit de Chloe est de reconstruire la Forteresse et que Jor-El la soigne.

   Chloe est heureuse de se marier avec Jimmy. Pendant ce temps, Oliver dit à Clark qu'il pense avoir découvert l'endroit où se cache Lex. Mais quand il arrive à Cuba pour le confronter, il est choqué de trouver Lana sur place. Loïs et Clark se rapprochent mais le chaos s'ensuit quand Doomsday provoque des dégâts lors de la cérémonie de mariage et tente d'enlever Chloe.

   Le lendemain de l'attaque de Doomsday pendant le mariage de Chloe et Jimmy laisse Clark en état de choc. Quand il s'apprête à partir à la recherche de son amie, Le Persuader apparaît et l'attaque. Rokk, Imra et Garth, également connu comme étant La Legion, viennent du futur pour aider à vaincre Le Persuader. Le groupe réalise alors que Brainiac a pris le contrôle de Chloe. Pendant ce temps, à la Forteresse, Brainiac informe Davis qu'il est Doomsday et qu'il a été créé pour tuer l'autre kryptonien et détruire le monde.

   Quand Clark découvre que John Jones s'est fait tirer dessus alors qu'il travaillait comme agent de police, il décide de revêtir l'uniforme pour démasquer le coupable. Pendant ce temps, Lana confronte Tess et lui dit que Lex n'est pas l'homme qu'elle croit qu'il est. Ces révélations choquantes forcent Tess à reconsidérer sa position à la tête de Luthorcorp.

   Clark trouve Tess dans l'appartement saccagé de Lana et réalise que cette dernière a disparu. Tess lui apprend alors que Lex est toujours vivant et qu'il pourrait avoir fait enlever Lana. Elle lui révèle ensuite la vérité sur ce qui est arrivé à la jeune femme après qu'elle se soit réveillée de son coma provoqué par Brainiac. Parallèlement, Tess entre par effraction dans un entrepôt secret de la LuthorCorp et est choquée par ce qu'elle y découvre.

   Une explosion à la LuthorCorp tue tous les membres du Conseil et blesse Oliver, qui était là pour annoncer la fusion de l'entreprise avec Queen Industries. Oliver pense que Lex est derrière tout ça mais Clark et Lana apprennent que le kamikaze est Winslow Schott, un ancien employé de Queen Industries qui éprouve de la rancune envers Oliver.

   Linda Lake revient à Metropolis et menace Clark de dévoiler son secret, sauf s'il lui promet de lui donner des informations exclusives sur la tâche rouge et bleue afin de redevenir la star des reporters qu'elle était. Refusant de céder au chantage, Clark avoue son secret à Loïs et lui demande d'écrire son histoire pour le Daily Planet.

   Tess invite Clark à une conférence de presse à New York, mais quand une explosion retentit dans le jet privé, le jeune homme doit trouver une solution pour sauver tout le monde sans que Tess ne découvre son secret. A l'insu de tous, Tess a en fait orchestré l'incident pour forcer Clark à dévoiler ses dons. Pendant ce temps, Davis découvre une surprenante façon de contrôler le monstre qui se cache en lui.

   Lors de la fête d'anniversaire de Chloe, une mystérieuse magicienne prénommée Zatanna fait le souhait que Chloe ressemble plus à Loïs et échange le corps des deux jeunes femmes. Zatanna recherche le livre de sorts de son père afin de pouvoir évoquer son esprit, mais pas avant d'avoir exaucé le voeu le plus cher de Clark.

   Tess tente de tuer Davis en faisant exploser son camion. Toutefois, quand il en réchappe, elle se rend compte qu'elle a besoin d'aide pour le détruire et elle se tourne vers Clark. Tess lui révèle le secret de l'enfance de Davis avec les Luthor et laisse entendre qu'elle connaît la véritable identité de Clark. Pendant ce temps, Davis demande de l'aide à Chloe.

   Loïs estime qu'elle a besoin d'une grosse histoire pour asseoir sa réputation en tant que journaliste, mais l'homme à la tâche rouge et bleue continue de lui échapper. Toutefois, quand Chloe se fait agresser, Loïs intervient pour repousser l'un des assaillants et utilise cette opportunité pour faire croire qu'il y a un nouveau super héros, Stiletto, qui est arrivé en ville et lui a accordé l'exclusivité. Clark est préoccupé par le fait que la jeune femme pourrait se blesser en jouant au super héros, mais après qu'il se fasse capturer par des voyous avec de la kryptonite, Loïs intervient pour le sauver.

   Clark apprend que Davis est toujours en vie et confronte Chloe sur le fait qu'elle le protège. De son côté, Oliver découvre Jimmy en train de s'introduire par effraction dans l'appartement de Chloe, mais les choses s'aggravent rapidement quand Davis sort de l'ombre et les attaque.

   Chloe revient et supplie Clark de tuer Davis, affirmant qu'il ne peut plus garder la bête sous contrôle. Tess a réuni une équipe de kryptomonstres, dont Plastique, pour traquer Davis afin que Clark puisse le tuer. Toutefois, les choses tournent mal quand les membres de l'équipe découvrent que Tess veut les doubler.

   Oliver dit à Clark qu'il doit tuer Davis car Doomsday est une menace sérieuse qui doit être arrêtée à tout prix. Cependant, Clark refuse de prendre une vie humaine, de sorte que l'Archer Vert et son équipe décident de prendre les choses en mains. Loïs s'en prend à Tess, mais la lutte prend une tournure innattendue. Pendant ce temps, Chloe se retrouve au milieu de la bataille que se livre Oliver et Clark sur la mort de Davis.